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目前在內政委員會裡的草案版本有民進黨立委提出的7個版本，內容大致相同，而國民黨團版則有「政黨財產監督管理條例草案」，兩黨版本內容差異很大。
》民進黨：林俊憲版、鄭運鵬版、高志鵬版、葉宜津版、黃偉哲版、鄭寶清版、陳亭妃版
》國民黨團版：「政黨財產監督管理條例草案」
如何認定「不當」？兩黨差很大
聯合報報導，由於黨產條例爭議大，聯席會上午沒有實質修法進度。內政部長陳威仁表示，支持把政黨財產攤在陽光下，但不當黨產條例的重點，不在黨產是否公開，重點是什麼叫「不當」，很多版本對「當」與「不當」認定，捨棄過去由法院公正判決的途徑，改用其他方式，恐讓問題更複雜，更不客觀。
對於認定不當黨產，民進黨版主張成立隸屬行政院的政黨財產調查及處理委員會，由檢察官、學者、社會公正人士組成，並限制同一黨籍委員人數。
國民黨則主張內政部為主管機關，對認定有疑慮的黨產應移請監察院調查，如果監察院認定為不當黨產，應於兩年內還給原權利人或機關團體。
根據自由時報報導，內政部指出，國民黨版對於施行前政黨取得的財產，主管機關認有爭議之虞移請監察院調查，但主管機關如何認定財產有爭議？其認定程序和標準為何？移請監院的相關規定和政黨如何權利救濟，皆未寫清楚，仍需釐清。
對於民進黨立委版本，內政部指出，「不當取得」需由政黨舉證合法，否則將財產移轉至特定基金或國有，與法治國家「法律不溯及既往原則」不符。
國、民兩黨黨產處置條例比一比（大紀元製圖）黃國昌：馬政府對不法黨產包庇縱容
立委黃國昌在質詢時談到中廣非法取得土地一事，他事後在臉書上發文痛批， 馬英九2008年說要將不當黨產歸還國家，但馬政府對不法黨產真正的態度是包庇縱容。
黃國昌舉了四個例子說明：
1. 將財政部在2004年設置的「國家資產經營管理委員會」及「黨產處理專案小組」，於2009年停止運作；2. 將行政院原來設置的「不當黨產網站」，偷偷移除；3. 法務部將2002年所曾提出的行政院版「政黨不當取得財產處理條例草案」，自法務部網站移除，企圖毀屍滅跡；4. 相關部會即使發現中國國民黨不法取得的財產，也竟然視而不見，以「還沒有編預算」這種荒謬的理由，放水不提訴追償。
黃國昌進一步舉例而表示，針對中廣非法取得「板橋機室」的土地，交通部2004年起訴後，在2014年8月早已取得勝訴確定判決，判定中廣「非法」接管原屬「日治時期台灣放送協會」的土地。然而，交通部卻迄今都遲遲不對中廣起訴追償「將該出賣予第三人」所得之不當得利價款。交通部到今天在立法院報告時，才急忙說明「視預算情形於105年、106年提訟追償」。他痛批：「這不是刻意放水，什麼才是刻意放水！」
馬政府對不法黨產的真正態度：包庇縱容馬英九2008年口口聲聲說，要將不當黨產歸還國家。然而，在他主政下的政府，實際的作為卻是：1. 將財政部在2004年設置的「國家資產經營管理委員會」及「黨產處理專案小組」，於2009年停止運作；...
由黃國昌貼上了 2016年3月13日
藍委：只看到清算鬥爭
據自由時報報導，國民黨立委賴士葆痛批，總統當選人蔡英文說要溝通溝通再溝通，但這法案只看到清算鬥爭，還針對國民黨中央、行管會發文邀請報告，針對性十足，應該各黨都要到立法院相關委員會列席，而是不針對某政黨立法，心態太偏頗。
國民黨立委黃昭順也痛批，國民黨所有立委非常磊落，提出版本出來審查，民進黨將蔡英文講的話付諸流水，清算、鬥爭、抹黑，憲法明文規定每個政黨都是公平競爭，有多少政黨拿了民脂民膏的政黨補助款，不該受透明檢視嗎？
引用資料：
自由時報／誰來認定黨產不當？綠︰設調查委員會 藍︰移請監院調查
