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根據專家指出，抗生素的不當使用，使得動物殘留的抗生素進到人體，最終可能產生抗藥性強的超級細菌，引發人生病而難治的嚴重問題。而基改飼料帶給動物的負面影響，也使問題更加複雜而嚴重化。
豬吃基改飼料易發炎
近年來，基改作物的飼料所可能衍生的問題備受關注，部分研究顯示，食用基改作物飼料的動物容易發炎，並可能出現生殖障礙。
澳洲弗林德斯大學Judy Carman教授最新進行的研究顯示，吃基改作物飼料的豬較容易發炎。她在研究報告中表示，在嚴謹的科學控制下，透過農場實地研究，發現吃基改作物飼料的豬胃部較容易發炎，且母豬的子宮比一般非餵食基改飼料的母豬重20%（可能是疾病所造成的，尚有待進一步調查）。
長期關注基改食物的台大農藝系退休教授郭華仁，也引用國際資料指出，基因改造產品存在致命風險。郭教授表示，近年來，兩位蘇俄的學者發現，老鼠吃了基改大豆以後，會產生病變，包括：身體比較小、不孕症（因為睪丸受到影響）等。此外，他國研究也顯示得到類似的結論，印度餵食基改作物飼料的水牛，罹患不孕症；美國長期餵食基改飼料的豬與牛，也發生不孕症。
遍尋不著非基改飼料
然而，台灣市場目前幾乎沒有非基改的玉米飼料。一位臉書名為「Emily Hu」的女士在臉書上po文《我養的雞~買不到非基改的飼料》，她表示自己打電話至雲林相關農會，詢問是否能夠買到非基改的玉米飼料，得到的結果是：「沒有在賣非基改的玉米飼料，一直以來農會都是賣基改的玉米飼料，台灣也沒有賣非基改的玉米飼料⋯⋯」
主婦聯盟基金會企編專員郭亭君也表示，就她了解，目前台灣飼料廠所進口的原料都是基改作物，而且製程中分為「加藥線」（抗生素等藥物直接添加到飼料中）與「空白線」（製程中不添加抗生素等藥物的產線）。目前，台灣只有一些小型農場會以非基改作物自製飼料。
濫用抗生素恐釀危害
抗生素濫用是另一個肉品安全的問題。國衛院感染症研究組特聘研究員蘇益仁在接受媒體採訪時表示，畜牧業濫用抗生素所引發的肉品安全，將是台灣尚未爆發的重大食安問題。他指出，據早年非正式監測所得資料顯示，台灣動物用抗生素的使用量是人用抗生素的8倍。人類如吃下這些因烹調加熱不完全，抗藥菌未被殺死的肉品，腸道原本的菌相將被破壞，好菌可能被連帶殺死，易引發過敏、氣喘、免疫系統等疾病。
前衛福部金門醫院感染控制室主任鄭元瑜更指出，在嚴格限制的情形下使用抗生素，都無法避免細菌產生抗藥性，如果是濫用，很可能讓整個環境，泥土裡、空氣裡的細菌都產生抗藥性，造成普通藥物失效，病人只要稍微有一點發炎、感染，就很嚴重，必須用很強的藥去治療。
美國克萊姆森大學昆蟲學博士陳禹西認為，動物的排泄物重金屬含量過高，是台灣畜牧與養殖上另一個嚴重的問題。「目前的養殖（雞、豬、魚等），為了要殺死腸道的有害菌，會在飼料裡面添加重金屬（主要是銅、鋅），動物的排泄物經過檢測，發現重金屬含量都非常高。」這些重金屬一方面排泄出去，進入環境中，造成環境汙染；一方面會被動物自體吸收，因此內臟跟脂肪會殘留許多重金屬，之後再進入人體。
食安從飼養開始改變
如果基改作物飼料、抗生素與重金屬的使用，會帶來動物病變或健康上的疑慮，而且對環境造成汙染，最終影響人的健康，面對這些問題，人們終歸要去關注從源頭改進肉品的食用安全，從飼養的方式、飼料等，確保動物的健康，從而獲得優質的肉品。
位於土城「輝要無毒菜園」的農友輝嫂表示，他們使用自製堆肥進行有機種植，而堆肥會生蛆，因此飼養家禽來吃蟲。這些野放的雞、鴨、鵝會自己去覓食；此外，也吃一些不要的菜，讓家禽成為有機種植當中友善循環的一環。他們的雞蛋成為熟客的最愛，「一些熟客因為身體因素不能吃外面的雞蛋，在他們的要求下我們才賣蛋，因為我們的雞鴨鵝完全沒有打抗生素。」
「棒打老虎，雞吃蟲」是大家耳熟能詳的划拳術語，考量要讓家人吃得健康，陳禹西於數年前購地開始從事有機農作，同時有以回歸自然食物鏈的方式來養雞。「雞吃蟲是自然界生態的一環，過去野放的雞會找蟲吃，但是可能半年、一年才吃到足夠的蟲。我們就是恢復牠過去原生種的特性，給牠吃足夠的蟲。」因此，陳禹西以他的專業來飼養鳳凰蟲，讓他養殖的雞隻有充分、健康的食物來源。
一如食安維護走向小農化，我們對自己吃的肉品來源，可能也需要進一步了解與掌握，才能維護吃下肚的肉食品安全無虞。◇
