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行政院將《兩岸人民關係條例》修正草案列為立法院本會期優先法案，明定兩岸任何政治協議都必須經過公投程序。陸委會主委陳明通19日坦言，該案是因為國民黨主席吳敦義提出，若當選總統將與中國簽和平協議，陸委會檢視發現《兩岸人民關係條例》門檻太低，所以才決定列為優先法案。
陳明通說，《兩岸人民關係條例》對政治議題談判的監督機制「很weak（微弱）」，陸委會過去也提過要有比較強力的監督機制，總統蔡英文年初提及4個必須與3個防護網，第三個防護網也就是在談監督機制。
他強調，兩岸政治性議題需要社會高度共識，不能像過去半分鐘就通過《兩岸服務貿易協議》，這樣會引起社會很大爭議，所以才要修法拉高門檻。根據陸委會規劃，未來若涉及政治議題的談判，須由政院提出談判計畫，經立法院3分之2委員同意後才可以談。
在談判之前，行政院為了解民意動向，可以舉辦諮詢性公投，不受《公民投票法》限制，談判過後，因立法院有審議權，所以由4分之3立法委員出席、並獲得4分之3同意後，再進行全國性的公民投票，達到全國選舉人數半數以上同意，才能夠通過。
陸委會認為，兩岸簽署政治協議的門檻太低，甚至可能僅是「備查」，所以決定把它列為優先法案。陳明通強調，修法並非為了阻擋什麼問題，重點是尋求社會高度共識。
隨後陸委會也發表聲明表示，在北京當局不斷強加「一個中國原則」、「一國兩制」的政治框架於台灣前提下，中華民國政府不主張簽任何消滅國家主權及台灣民主的政治協議。
針對兩岸間的任何政治性協議，陸委會表示，政府已規劃建立一個強力的民主防衛機制，也就是總統所說的「民主防護網」，避免任何政黨執政，將個人或政黨意志凌駕在民意之上，以主權當作籌碼，導致危害主權、傷害民主的不可逆結果。◇
