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台大校長遴選爭議不斷，教育部最終做出不聘任的決議，要求回到推薦資格初審階段。私立大學校院協進會29日發聲明表示，對於教育部就台大校長遴選案未能依法行政、不尊重大學自主的舉措，實難認同。
聲明提到，大學自治是《憲法》保障學術自由的核心價值，公私立大學校長的遴選，則是《大學法》第9條明白揭示的大學自治事項。教育部依據該條第3項制定有《國立大學校長遴選委員會組織及運作辦法》，台灣大學據以訂定其《校長遴選委員會組織及運作要點》。因此，教育部對台灣大學校長遴選事項的監督，必須依據前述法令規定為之，否則就是違法、違憲，不是民主法治社會應有的亂象。
前述教育部和台大訂定的大學長遴選規範，均明確指出校長候選人資格之審核及最後人選之決定，屬於校長遴選委員會的任務，教育部的職責則是就遴選委員會選定的人選完成「聘任」程序，這也是《大學法》第9條第1項界定的大學自治重要內涵之一。
此外，聲明還提到，教育部對大學之監督，應於法律規定範圍內為之，並須符合大學自治原則，此乃大法官釋字第380號、第450號等解釋一再揭櫫的憲政法治意旨。有關台大校長候選人資格及特定遴選委員應否迴避的爭議，業經合法組成且包括3位教育部指派代表在內的遴選委員會多次開會討論審議，確認沒有疑義。類似涉及學術自由的專業決定，除非有明顯之重大違法情事，否則連司法機關都必須選擇尊重，不得任意推翻，遑論職司大學監督的行政機關。
不過，立法院教育及文化委員會、民進黨立委黃國書說，管中閔未來也是可以成為校長的候選人，但有適法上問題，因為管中閔在赴中國大陸等部分，的確有違反相關規定，當然作為校長候選人的適法性是有疑義，而這些問題是沒有辦法補正的，因此管中閔沒有辦法參與未來的校長遴選。◇
