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肝膿瘍就是肝臟組織被細菌感染，造成肝組織局部壞死、液化及膿瘍，大部分經由膽道感染，有時可見多腔洞的化膿。感染源可是細菌、阿米巴原蟲，在極少數免疫極差的病人身上可能是真菌感染。
臨床表現常為發燒與腹痛，但有些人沒有什麼特別的症狀，甚至連右上腹肝區的位置也不會疼痛。電腦斷層，無論是有打顯影劑還是沒打顯影劑，都可以看的出來，超音波也可看到化膿的區塊。治療上主要是應用抗生素，嚴重的可加上外科引流。肝膿瘍若不治療，死亡率可說是100%，及時的治療可讓死亡率降低到5%到30%左右。
肝膿瘍的細菌感染源大部分是膽囊發炎、肝臟膽石症發炎、膽道發炎而來，少部分由其他地方感染而來，若有到過熱帶地區環境衛生不良的地方旅遊，則要考慮阿米巴原蟲感染。常見的感染細菌包括鏈球菌(Streptococcus spp.)、大腸桿菌(Escherichia coli)、克雷伯氏菌(Klebsiella)與擬桿菌(Bacteroides)，有些病人還會有兩種以上細菌同時感染。最常造成肝膿瘍的阿米巴原蟲為痢疾阿米巴( Entamoeba histolytica)，幾乎都是首先大腸感染，然後擴散到肝臟。若小孩罹患肝膿瘍，則要考慮免疫低下的問題。
肝膿瘍一開始都只有一個膿腔，在惡化擴散後才會形成為多個膿腔；肝右葉比肝左葉容易受到感染。有時需要抽取肝膿液做培養，以選擇更對症的抗生素。
阿米巴原蟲造成的肝膿瘍在某些地區特別高，如墨西哥、印度、東非與南非、部分中南美洲。免疫功能較差與嗜酒的人比較容易產生阿米巴肝膿瘍。
